История

Создан в 1996 году, объединив два любительских клуба «Новатор» и «Родина», выступавших на первенстве города и Московской области. Первым тренером клуба стал Владимир Штапов. В дебютном выступлении в любительской лиге, клуб завоевал путёвку в третью лигу, а на следующий год сумел пробиться и во вторую. В 2000 году тренером стал Виктор Папаев, известный в прошлом полузащитник Спартака. Ему удалось вывести команду в первый дивизион. Хотя, за счёт гостевых мячей, Химки сначала уступили это право Северстали в стыковых матчах. Однако, Северсталь играть в первом дивизионе отказалась.

Во время пребывания в первом дивизионе команду постоянно лихорадило, менялись тренеры, руководство клуба. В 2004 году президентом клуба стал Владимир Стрельченко, который серьёзно взялся за дело, тренировать команду пришёл Павел Яковенко, в составе стали появляться именитые в прошлом футболисты Георгий Ломая, Александр Данишевский, Виталий Гришин, Павел Погребняк, Андрей Тихонов, Владимир Бесчастных, Роман Березовский, Юрий Дроздов. В сезоне 2005 года клуб вышел в финал Кубка России, где в упорной борьбе уступил московским армейцам. В конце сезона 2005 года за два тура до финиша первенства, когда стало ясно, что с задачей выхода в высшую лигу справится не удалось, был отзаявлен вице-президент клуба Андрей Червиченко, который являлся соинвестором клуба. После окончания первенства, вместе с ним ушла большая группа футболистов, а также и главный тренер Павел Яковенко. В сезоне 2006 года клуб практически полностью обновил состав, главным тренером был назначен Владимир Казаченок. В сезоне 2006 года клуб стал победителем чемпионата России в Первом дивизионе, обыграв в последнем туре краснодарскую «Кубань» и завоевал право представлять Московскую область в Премьер-лиге. 5 сентября 2007 года руководством клуба была принята отставка главного тренера команды Владимира Александровича Казаченка. Перед матчем 13-го тура с санкт-петербургским «Зенитом» Владимир Александрович был госпитализирован с диагнозом «гипертонический криз», но спустя время после амбулаторного лечения он все-таки вернулся к работе. Через некоторое время он опять почувствовал ухудшение своего состояния и врачи рекомендовали ему обратить внимание на свое здоровье. Исходя из этого Владимир Александрович принял решение оставить пост главного тренера команды. 8 сентября, руководством ФК «Химки» в лице генерального директора Михаила Щеглова был подписан контракт с сербским тренером Славолюбом Муслиным, ранее работавшим в России с московским «Локомотивом». Срок соглашения – 2,5 года. После подписания контракта новый наставник «Химок» сразу же приступил к исполнению своих обязанностей. 11 ноября 2007 года ФК "Химки" принимали у себя на поле Самарские "Крылья Советов", выиграв у них со счетом 4:1, и, тем самым завоевав себе 9 место в чемпионате России.

Достижения
Финалист Кубка России: 2005/06